Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLD1P28340 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 VGLL1-201ENST00000370634 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 RN7SL202P-201ENST00000584410 262 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD1P28340 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD1P28340 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms