Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CNTFRP26992 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms