Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGA6P23229 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGA6P23229 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms