Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
V9GY48 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
V9GY48 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
V9GY48 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
V9GY48 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
V9GY48 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
V9GY48 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
V9GY48 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
V9GY48 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
V9GY48 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
V9GY48 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
V9GY48 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
V9GY48 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
V9GY48 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
V9GY48 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
V9GY48 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
V9GY48 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
V9GY48 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
V9GY48 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
V9GY48 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
V9GY48 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
V9GY48 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
V9GY48 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
V9GY48 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
V9GY48 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
V9GY48 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
V9GY48 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
V9GY48 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
V9GY48 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
V9GY48 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
V9GY48 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
V9GY48 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
V9GY48 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
V9GY48 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
V9GY48 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
V9GY48 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
V9GY48 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
V9GY48 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
V9GY48 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
V9GY48 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
V9GY48 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
V9GY48 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
V9GY48 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
V9GY48 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
V9GY48 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
V9GY48 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
V9GY48 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
V9GY48 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
V9GY48 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
V9GY48 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
V9GY48 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
V9GY48 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
V9GY48 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
V9GY48 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
V9GY48 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
V9GY48 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
V9GY48 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
V9GY48 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
V9GY48 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
V9GY48 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
V9GY48 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
V9GY48 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
V9GY48 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
V9GY48 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
V9GY48 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
V9GY48 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
V9GY48 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
V9GY48 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
V9GY48 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
V9GY48 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
V9GY48 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
V9GY48 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
V9GY48 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
V9GY48 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
V9GY48 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
V9GY48 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
V9GY48 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
V9GY48 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
V9GY48 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
V9GY48 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
V9GY48 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
V9GY48 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
V9GY48 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
V9GY48 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
V9GY48 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
V9GY48 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
V9GY48 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
V9GY48 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
V9GY48 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
V9GY48 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
V9GY48 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
V9GY48 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
V9GY48 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
V9GY48 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
V9GY48 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
V9GY48 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
V9GY48 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
V9GY48 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
V9GY48 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
V9GY48 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms