Protein–RNA interactions for Protein: V9GXZ4

FPGT-TNNI3K, FPGT-TNNI3K readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms