Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB12Q9Y5F1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms