Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF330Q9Y3S2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNF330Q9Y3S2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNF330Q9Y3S2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms