Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2J1Q9Y385 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE2J1Q9Y385 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1651.8 ms