Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2H6

FNDC3A, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3AQ9Y2H6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FNDC3AQ9Y2H6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms