Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTNND2Q9UQB3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms