Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
THSD7AQ9UPZ6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
THSD7AQ9UPZ6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
THSD7AQ9UPZ6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
THSD7AQ9UPZ6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
THSD7AQ9UPZ6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
THSD7AQ9UPZ6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
THSD7AQ9UPZ6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
THSD7AQ9UPZ6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
THSD7AQ9UPZ6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
THSD7AQ9UPZ6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
THSD7AQ9UPZ6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
THSD7AQ9UPZ6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
THSD7AQ9UPZ6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms