Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SHANK2Q9UPX8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
SHANK2Q9UPX8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC33.82■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.81■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC33.81■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC33.78■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SHANK2Q9UPX8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms