Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU5

USP24, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24, humanhuman

Predictions only

Length 2,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP24Q9UPU5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP24Q9UPU5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP24Q9UPU5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms