Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM35Q9UPQ4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRIM35Q9UPQ4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRIM35Q9UPQ4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms