Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP4E1Q9UPM8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP4E1Q9UPM8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms