Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX6Q9UNH7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX6Q9UNH7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms