Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX12Q9UMY4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX12Q9UMY4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms