Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLEC4EQ9ULY5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLEC4EQ9ULY5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms