Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
TPCN1Q9ULQ1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TPCN1Q9ULQ1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms