Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NRXN1Q9ULB1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NRXN1Q9ULB1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC32■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NRXN1Q9ULB1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms