Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL46

PSME2, Proteasome activator complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME2Q9UL46 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME2Q9UL46 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME2Q9UL46 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME2Q9UL46 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME2Q9UL46 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME2Q9UL46 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME2Q9UL46 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME2Q9UL46 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME2Q9UL46 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME2Q9UL46 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME2Q9UL46 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME2Q9UL46 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME2Q9UL46 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME2Q9UL46 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME2Q9UL46 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME2Q9UL46 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME2Q9UL46 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME2Q9UL46 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME2Q9UL46 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME2Q9UL46 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME2Q9UL46 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME2Q9UL46 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME2Q9UL46 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME2Q9UL46 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME2Q9UL46 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME2Q9UL46 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME2Q9UL46 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME2Q9UL46 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSME2Q9UL46 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PSME2Q9UL46 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME2Q9UL46 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms