Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG0

DCDC2, Doublecortin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC2Q9UHG0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCDC2Q9UHG0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCDC2Q9UHG0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms