Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SRP68Q9UHB9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRP68Q9UHB9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRP68Q9UHB9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms