Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AFF4Q9UHB7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AFF4Q9UHB7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFF4Q9UHB7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFF4Q9UHB7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFF4Q9UHB7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
AFF4Q9UHB7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
AFF4Q9UHB7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFF4Q9UHB7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AFF4Q9UHB7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFF4Q9UHB7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFF4Q9UHB7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AFF4Q9UHB7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms