Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP3AQ9UFN0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms