Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEW3

MARCO, Macrophage receptor MARCO, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCOQ9UEW3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCOQ9UEW3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCOQ9UEW3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCOQ9UEW3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCOQ9UEW3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCOQ9UEW3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCOQ9UEW3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCOQ9UEW3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCOQ9UEW3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCOQ9UEW3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCOQ9UEW3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCOQ9UEW3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCOQ9UEW3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCOQ9UEW3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCOQ9UEW3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCOQ9UEW3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCOQ9UEW3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCOQ9UEW3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCOQ9UEW3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCOQ9UEW3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCOQ9UEW3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCOQ9UEW3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARCOQ9UEW3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARCOQ9UEW3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCOQ9UEW3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARCOQ9UEW3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARCOQ9UEW3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARCOQ9UEW3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCOQ9UEW3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCOQ9UEW3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms