Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VTI1BQ9UEU0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTI1BQ9UEU0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1BQ9UEU0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms