Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIP2Q9UDT6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CLIP2Q9UDT6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms