Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APEX2Q9UBZ4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APEX2Q9UBZ4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms