Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNAL1Q9UBT7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNAL1Q9UBT7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms