Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
POLKQ9UBT6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
POLKQ9UBT6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLKQ9UBT6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms