Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DKK3Q9UBP4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DKK3Q9UBP4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms