Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPASTQ9UBP0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPASTQ9UBP0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms