Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PEMTQ9UBM1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PEMTQ9UBM1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms