Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNMT3BQ9UBC3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms