Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC88CQ9P219 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC88CQ9P219 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms