Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC46.91■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.91■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC46.9■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.9■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC46.9■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.9■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC46.9■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC46.9■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC46.9■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC46.89■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.89■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC46.89■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC46.89■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC46.88■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.88■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
CCDC180Q9P1Z9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC46.87■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC46.87■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC46.87■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC46.86■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC46.86■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC46.85■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC46.85■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.84■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC46.84■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC46.84■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.83■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC46.83■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC46.83■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC46.83■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC46.83■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC46.83■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC46.82■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC46.82■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC46.82■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC46.82■■■■■ 5.09
CCDC180Q9P1Z9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.81■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.81■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC46.8■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC46.8■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC46.8■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.8■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC46.8■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC46.79■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC46.79■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC46.79■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.79■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC46.79■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC46.79■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC46.78■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC46.78■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC46.78■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC46.78■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC46.78■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.78■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.77■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC46.77■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC46.77■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC46.77■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC46.77■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC46.77■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC46.77■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC46.76■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC46.76■■■■■ 5.08
CCDC180Q9P1Z9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC46.76■■■■■ 5.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms