Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMCD1Q9NZU5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMCD1Q9NZU5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms