Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNK4Q9NYG8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNK4Q9NYG8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms