Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMPD3Q9NY59 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMPD3Q9NY59 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMPD3Q9NY59 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMPD3Q9NY59 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMPD3Q9NY59 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMPD3Q9NY59 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMPD3Q9NY59 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMPD3Q9NY59 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMPD3Q9NY59 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMPD3Q9NY59 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMPD3Q9NY59 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMPD3Q9NY59 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMPD3Q9NY59 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMPD3Q9NY59 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMPD3Q9NY59 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMPD3Q9NY59 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMPD3Q9NY59 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMPD3Q9NY59 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMPD3Q9NY59 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms