Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY12

GAR1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAR1Q9NY12 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GAR1Q9NY12 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms