Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRMT1Q9NXH9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRMT1Q9NXH9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms