Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RLIMQ9NVW2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RLIMQ9NVW2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms