Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM30AQ9NV96 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM30AQ9NV96 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms