Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF3Q9NUQ8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCF3Q9NUQ8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 369.9 ms