Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMBRD1Q9NUN5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms