Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUE0

ZDHHC18, Palmitoyltransferase ZDHHC18, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC18Q9NUE0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZDHHC18Q9NUE0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZDHHC18Q9NUE0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ZDHHC18Q9NUE0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ZDHHC18Q9NUE0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZDHHC18Q9NUE0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZDHHC18Q9NUE0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZDHHC18Q9NUE0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZDHHC18Q9NUE0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZDHHC18Q9NUE0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZDHHC18Q9NUE0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZDHHC18Q9NUE0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZDHHC18Q9NUE0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZDHHC18Q9NUE0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZDHHC18Q9NUE0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZDHHC18Q9NUE0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZDHHC18Q9NUE0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZDHHC18Q9NUE0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms