Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOMER2Q9NSB8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOMER2Q9NSB8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms