Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GKN1Q9NS71 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GKN1Q9NS71 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms