Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HELLSQ9NRZ9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms